MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 87997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	CCG	2	6	12	17	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
2	NC_007677	CAT	2	6	43	48	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815237
3	NC_007677	GCC	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
4	NC_007677	GGA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
5	NC_007677	GAC	2	6	122	127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
6	NC_007677	TAC	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815237
7	NC_007677	GAG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
8	NC_007677	TC	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	83815237
9	NC_007677	ACG	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
10	NC_007677	GAC	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
11	NC_007677	GGA	2	6	277	282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
12	NC_007677	CCGGC	2	10	311	320	0 %	0 %	40 %	60 %	83815237
13	NC_007677	C	6	6	344	349	0 %	0 %	0 %	100 %	83815237
14	NC_007677	GCC	2	6	373	378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
15	NC_007677	TCG	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815237
16	NC_007677	CGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815237
17	NC_007677	CGCC	2	8	420	427	0 %	0 %	25 %	75 %	83815237
18	NC_007677	GCCC	2	8	443	450	0 %	0 %	25 %	75 %	83815237
19	NC_007677	CGA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
20	NC_007677	GCAG	2	8	460	467	25 %	0 %	50 %	25 %	83815237
21	NC_007677	CGA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
22	NC_007677	TCCAG	2	10	496	505	20 %	20 %	20 %	40 %	83815237
23	NC_007677	CTCG	2	8	605	612	0 %	25 %	25 %	50 %	83815237
24	NC_007677	GCC	2	6	617	622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
25	NC_007677	CGG	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
26	NC_007677	TCT	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815237
27	NC_007677	CAC	2	6	781	786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83815237
28	NC_007677	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
29	NC_007677	CGG	2	6	883	888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
30	NC_007677	AGG	2	6	903	908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
31	NC_007677	TTC	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815237
32	NC_007677	CGG	2	6	963	968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
33	NC_007677	CCG	2	6	974	979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
34	NC_007677	CG	3	6	978	983	0 %	0 %	50 %	50 %	83815237
35	NC_007677	GAG	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
36	NC_007677	CCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
37	NC_007677	CCG	2	6	1081	1086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
38	NC_007677	GAC	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
39	NC_007677	CGA	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
40	NC_007677	GC	3	6	1176	1181	0 %	0 %	50 %	50 %	83815237
41	NC_007677	GCC	2	6	1274	1279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
42	NC_007677	CGA	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
43	NC_007677	AAG	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83815237
44	NC_007677	CGG	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
45	NC_007677	CAA	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83815237
46	NC_007677	GGA	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
47	NC_007677	GAC	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
48	NC_007677	TCG	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007677	CCT	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
50	NC_007677	ATC	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814447
51	NC_007677	CGG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814447
52	NC_007677	GGAT	2	8	2013	2020	25 %	25 %	50 %	0 %	83814447
53	NC_007677	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
54	NC_007677	ACG	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
55	NC_007677	GGA	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
56	NC_007677	GCA	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
57	NC_007677	G	6	6	2113	2118	0 %	0 %	100 %	0 %	83814447
58	NC_007677	CCT	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
59	NC_007677	ATG	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814447
60	NC_007677	GAG	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
61	NC_007677	GGT	2	6	2224	2229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
62	NC_007677	CGAC	2	8	2232	2239	25 %	0 %	25 %	50 %	83814447
63	NC_007677	CCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814447
64	NC_007677	GGA	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
65	NC_007677	CGA	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
66	NC_007677	GAC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
67	NC_007677	CGA	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
68	NC_007677	GTC	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814447
69	NC_007677	CTC	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
70	NC_007677	GAG	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
71	NC_007677	CGA	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
72	NC_007677	GGT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
73	NC_007677	CGA	3	9	2785	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
74	NC_007677	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814447
75	NC_007677	CTG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
76	NC_007677	ACG	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
77	NC_007677	CG	3	6	3039	3044	0 %	0 %	50 %	50 %	83816215
78	NC_007677	GCGCAA	2	12	3061	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
79	NC_007677	CGGT	2	8	3168	3175	0 %	25 %	50 %	25 %	83816215
80	NC_007677	AAC	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816215
81	NC_007677	TCG	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
82	NC_007677	GCC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
83	NC_007677	CGA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
84	NC_007677	GCA	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
85	NC_007677	CGT	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
86	NC_007677	ACT	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816215
87	NC_007677	C	6	6	3449	3454	0 %	0 %	0 %	100 %	83816215
88	NC_007677	AGG	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816215
89	NC_007677	AAG	2	6	3475	3480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816215
90	NC_007677	CCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
91	NC_007677	CCG	2	6	3625	3630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
92	NC_007677	TCC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816215
93	NC_007677	GC	3	6	3668	3673	0 %	0 %	50 %	50 %	83816215
94	NC_007677	GGAG	2	8	3767	3774	25 %	0 %	75 %	0 %	83816215
95	NC_007677	CGAC	2	8	3805	3812	25 %	0 %	25 %	50 %	83816215
96	NC_007677	G	6	6	3829	3834	0 %	0 %	100 %	0 %	83816215
97	NC_007677	TTC	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816215
98	NC_007677	TCAT	2	8	3924	3931	25 %	50 %	0 %	25 %	83816215
99	NC_007677	CT	3	6	4067	4072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007677	TTC	2	6	4291	4296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815766
101	NC_007677	CGG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815766
102	NC_007677	TCGA	2	8	4448	4455	25 %	25 %	25 %	25 %	83815766
103	NC_007677	AC	3	6	4501	4506	50 %	0 %	0 %	50 %	83815766
104	NC_007677	TCG	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815766
105	NC_007677	CGGA	2	8	4602	4609	25 %	0 %	50 %	25 %	83815766
106	NC_007677	TCT	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815766
107	NC_007677	CCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815766
108	NC_007677	TTCG	2	8	4729	4736	0 %	50 %	25 %	25 %	83815766
109	NC_007677	CGAT	2	8	4769	4776	25 %	25 %	25 %	25 %	83815766
110	NC_007677	GGA	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815766
111	NC_007677	CGC	2	6	4933	4938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007677	AGA	2	6	4942	4947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007677	C	7	7	4993	4999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_007677	CCT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814655
115	NC_007677	GGCG	2	8	5145	5152	0 %	0 %	75 %	25 %	83814655
116	NC_007677	GCCCC	2	10	5157	5166	0 %	0 %	20 %	80 %	83814655
117	NC_007677	GTTCG	2	10	5185	5194	0 %	40 %	40 %	20 %	83814655
118	NC_007677	CGA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814655
119	NC_007677	TCAG	2	8	5369	5376	25 %	25 %	25 %	25 %	83814655
120	NC_007677	ACC	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814655
121	NC_007677	CGGC	2	8	5489	5496	0 %	0 %	50 %	50 %	83814655
122	NC_007677	GGAGAA	2	12	5691	5702	50 %	0 %	50 %	0 %	83814655
123	NC_007677	CCCAC	2	10	5711	5720	20 %	0 %	0 %	80 %	83814655
124	NC_007677	ATC	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814655
125	NC_007677	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814655
126	NC_007677	TCG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814655
127	NC_007677	GTC	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814655
128	NC_007677	TCT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83814655
129	NC_007677	AGC	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814655
130	NC_007677	ATG	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814655
131	NC_007677	ACG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007677	CCG	2	6	6108	6113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007677	TCG	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814221
134	NC_007677	CAC	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814221
135	NC_007677	CGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814221
136	NC_007677	GAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814221
137	NC_007677	GC	4	8	6299	6306	0 %	0 %	50 %	50 %	83814221
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272	NC_007677	CCGG	2	8	11639	11646	0 %	0 %	50 %	50 %	83814252
273	NC_007677	TCG	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814252
274	NC_007677	TCA	2	6	11733	11738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814252
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280	NC_007677	ATG	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814252
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290	NC_007677	CTC	2	6	12420	12425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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303	NC_007677	AGA	2	6	13143	13148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_007677	ACGG	2	8	15782	15789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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390	NC_007677	GGCCGA	2	12	17276	17287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83815143
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394	NC_007677	GGC	2	6	17435	17440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815143
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398	NC_007677	CGAGGA	2	12	17519	17530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83815143
399	NC_007677	TCA	2	6	17578	17583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815143
400	NC_007677	CTG	2	6	17595	17600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815143
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